Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pja1O55176 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms