Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms