Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DffaO54786 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DffaO54786 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DffaO54786 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms