Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd2O35927 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ctnnd2O35927 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnd2O35927 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms