Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pik3cdO35904 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms