Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn1mwO35599 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms