Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccrl2O35457 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms