Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt1O35449 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Prrt1O35449 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Prrt1O35449 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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