Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms