Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcns1O35173 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcns1O35173 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms