Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc23O35125 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc23O35125 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms