Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casq1O09165 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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