Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha8O09127 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha8O09127 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms