Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps1O08983 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hps1O08983 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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