Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casp6O08738 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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