Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer2J3QPU5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms