Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms