Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20696H3BJN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20696H3BJN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms