Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox6G3X9U1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox6G3X9U1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox6G3X9U1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox6G3X9U1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox6G3X9U1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox6G3X9U1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox6G3X9U1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms