Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r167G3UW71 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r167G3UW71 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Vmn1r167G3UW71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn1r167G3UW71 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn1r167G3UW71 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn1r167G3UW71 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r167G3UW71 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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