Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd5G3UW60 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd5G3UW60 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms