Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd50F7BE84 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd50F7BE84 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms