Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm28048F7BCN0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28048F7BCN0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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