Protein–RNA interactions for Protein: F7AXK2

Gm8871, Predicted pseudogene 8871 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8871F7AXK2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8871F7AXK2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms