Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms