Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2bE9QAN8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2bE9QAN8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms