Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmod3E9QA62 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmod3E9QA62 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms