Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ccdc7bE9Q9Y3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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