Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdhr2E9Q7P9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdhr2E9Q7P9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms