Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtproE9Q612 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtproE9Q612 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms