Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc71lE9Q4T4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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