Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lrp3E9Q1T6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lrp3E9Q1T6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lrp3E9Q1T6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Lrp3E9Q1T6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Lrp3E9Q1T6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrp3E9Q1T6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrp3E9Q1T6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrp3E9Q1T6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrp3E9Q1T6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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