Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzd2E9Q1M1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms