Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myo5cE9Q1F5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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