Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph10bE9PYQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms