Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sfta2E9PXB6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms