Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrt2E9PUL5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms