Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rdh8D3Z6W3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms