Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5478D3Z6R0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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