Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5934D3Z4U6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5934D3Z4U6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms