Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5930D3Z257 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5930D3Z257 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5930D3Z257 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5930D3Z257 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5930D3Z257 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5930D3Z257 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms