Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms