Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SafbD3YXK2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SafbD3YXK2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms