Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatipB9EKE5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CatipB9EKE5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms