Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rrn3B2RS91 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rrn3B2RS91 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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