Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssxb8B1AY40 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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