Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox1B1APN4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms