Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem238A9JSM3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms