Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra4A2RT60 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms