Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtf1A2AQ19 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms